Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
FmodP50608 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms