Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms