Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gli1P47806 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms