Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbP41155 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms