Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ThpoP40226 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms