Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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