Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BgnP28653 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BgnP28653 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BgnP28653 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BgnP28653 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms