Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gjb1P28230 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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