Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd12P23812 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd12P23812 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd12P23812 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd12P23812 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms