Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hoxd8P23463 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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