Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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PdgfaP20033 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfaP20033 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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