Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18533 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18533 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms