Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P18526 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18526 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18526 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18526 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms