Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcnaP17918 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PcnaP17918 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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