Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms