Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nr4a1P12813 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms