Protein–RNA interactions for Protein: P11499

Hsp90ab1, Heat shock protein HSP 90-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsp90ab1P11499 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsp90ab1P11499 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms