Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms