Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01667 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01667 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01667 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P01667 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P01667 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P01667 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P01667 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P01667 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P01667 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P01667 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P01667 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P01667 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms