Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01655 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01655 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01655 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms