Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp4O70480 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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