Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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