Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E2f6O54917 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms