Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timm44O35857 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Timm44O35857 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timm44O35857 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms