Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Prrt1O35449 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Prrt1O35449 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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