Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Kcns1O35173 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms