Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alx4O35137 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alx4O35137 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alx4O35137 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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