Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MttpO08601 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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MttpO08601 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MttpO08601 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms