Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sec22bO08547 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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