Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Gm21887J3QQ04 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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