Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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