Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm3727J3QM54 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm3727J3QM54 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm3727J3QM54 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm3727J3QM54 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm3727J3QM54 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm3727J3QM54 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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