Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms