Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms