Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf148G3X9R7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf148G3X9R7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms