Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M1F7CXU4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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