Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm28048F7BCN0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28048F7BCN0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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