Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
R3hdm1E9Q9Q2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
R3hdm1E9Q9Q2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms