Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms