Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gimd1E9PW74 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms