Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms