Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Vpreb3D3Z6J4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms