Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms