Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm6685D3YYP3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms