Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Kif28pD3YXS5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms