Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tmf1B9EKI3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmf1B9EKI3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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