Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clrn2B2RVW2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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