Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
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