Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrt4B2RU40 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms