Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Rrn3B2RS91 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rrn3B2RS91 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rrn3B2RS91 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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